内蒙古医学院坐落于内蒙古自治区首府呼和浩特市，是一所以医学为主，集理学、工学、管理学、文学于一体的综合性高等医药院校。学校成立于1956年，是新中国在少数民族地区最早建立的高等医学院校之一，当时隶属于国家卫生部，1958年划归内蒙古自治区管理。
内蒙古医学院始建于1956年，是自治区第一所高等医药院校，内蒙古医学院拥有雄厚的师资力量、较为完善的教学、科研、医疗和实验条件，1978年全国恢复研究生制度开始招收研究生，当年只有理学等4个专业的7名正副教授试行招收了4名研究生，研究生的培养和管理隶属教务处师资管理科，随着全国研究生工作的进一步发展，该校研究生数量逐年增加，加之该校师资力量不断壮大，逐步开展了研究生的学位授予工作。1981年全国开始实施学位制度，该校于同年11月3日经国务院批准首批获准具有学位、硕士学位授权资格单位，同时药理学、眼科学、外科学（普外、泌尿外）三个学科、专业拥有硕士学位授权点。
1982年7月内蒙高教局批准该校正式成立校级学位评定委员会，它是硕士级学位组织。学位评定委员会委员均由具有教授和副教授职称的教师担任，第一届主席由该校当时主管教学、科研的王聘臣副院长担任。学位评定委员会的成立标志着该校独立开展研究生学位授予工作的开始，每届委员会都认真履行了自己的职责，在完善和加强研究生学位授予工作方面起到了积极的作用。
1986年9月在教务处内设立研究生科，配备了专职人员，从此研究生教育开始了规范化教育阶段。
1998年9月随着全国“积极发展”研究生教育战略的实施，学校根据教学、科研、医疗和管理等诸方面的条件，提出了积极发展研究生教育的办学方针，成立了研究生处级建制单位，教务处原研究生科的管理职能划归研究生处，同时撤消研究生科。2001年6月学校毕业证机构改革，研究生处改制为研究生部并划为业务职能部门。2004年10月为了加速研究生教育发展，以综合性医科大学内涵建设要求，成立了研究生学院同时撤消了研究生部，属于二级教学单位。
截至2009年，内蒙古医学院毕业证样本为国家培养各级各类人才3万余名，为自治区经济发展、社会进步、科技创新、民族繁荣做出了重要贡献，已成为一所具有鲜明办学特色的地方高等医药院校。2007年，学校顺利通过国家教育部本科教学工作水平评估，被评为“优秀”等次。
学校设有临床医学部、基础医学院毕业证样本、中医学院毕业证样本、蒙医药学院毕业证样本、药学院毕业证样本、护理学院毕业证样本、公共卫生管理学院毕业证样本、公共教育学院毕业证样本、医药应用技术学院毕业证样本、研究生学院毕业证样本、鄂尔多斯分院和继续教育培训中心等12个教学单位，有5所附属医院（3所为直属附属医院、2所为非直属附属医院），在区内外设有24所临床教学医院和46个其它专业实践教学基地。