2000年3月，经教育部和湖北省人民政府批准，在孝感师范高等专科学校毕业证样本的基础上建立孝感学院毕业证样本。孝感学院实行湖北省和孝感市共建共管 、以省为主的管理体制。
新组建的孝感学院专业较为齐全，涵盖经济学、法学、教育学、文学、理学、工学、农学等7大学科门类，设有16个系（部），即中文系、数学系、物理系、化学系、英语系、生物系、农学系、园艺系、政治系、艺术系、计算机系、经济系、土木系、城建系、体育课部、教育心理课部。思想政治教育、汉语言文学、英语、美术学、数学与应用数学、物理学、化学、生物科学、计算机科学与技术、土木工程、农学、园艺学等本科专业当年开始招生。音乐学、经济学、电子信息科学与技术等3个专业以“3+1”和“2+2”形式招收本科生，本、专科学生达到6000余人，学校的办学规模进一步扩大，教育资源得到了优化配置，综合实力明显增强。
2001年，学校新增开了电子信息科学与技术和经济学2个本科专业，普通全日制本专科生达到7746人。
2001年11月18日，学校隆重举行“孝感学院揭牌庆典暨与武汉大学联合办学签字仪式”，充分发挥武汉大学毕业证样本等重点高校在教学、科研、师资和管理等方面的优势，支持和帮助学校毕业证实现跨越式发展。
2002年至2003年，学校相继增加了体育教育、音乐学、教育技术学、法学、材料化学、环境科学、城市规划等7个本科专业，本专科普通全日制在校生达到8419人。
2003年3月，经教育部和省教育厅批准，成立具有新办学模式的独立学院――孝感学院新技术学院毕业证样本，设置本、专科专业20余个，并于当年开始招生。
2004年，学校增加广告学、给水排水工程、艺术设计、小学教育、生物工程等5个本科专业。学校的学科专业建设取得重大突破，先后建立了湖北省高校人文社科重点研究基地――湖北小城镇发展研究中心、省级重点立项建设实验室――湖北省作物病害监测和安全控制实验室和省级立项建设基础课教学实验示范中心――湖北省化学基础课教学示范中心。2005年学校新增了科学教育、高分子材料与工程、建筑学等3个本科专业，使全校本科专业数达到29个，普通全日制本、专科学生规模突破万人大关，达到10709人，生源涵盖全国30个省、市、区。
前身是1943年在湖北随县（现随州市）创建的湖北省立第三师范学校毕业证。1947年9月，学校由随县迁往安陆县（现安陆市）。1948年2月更名为湖北省立安陆师范学校毕业证。同年12月，学校又迁往武汉市的汉阳显正街和武昌后补街等处。1949年6月，学校迁回安陆县，在现城关二小校址复课。1950年春，又迁至原孝感县三汊埠，改名为孝感师范学校毕业证。1951年秋，学校在孝感城关北门外兴建校舍。1952年，搬迁至新校舍，即今孝感学院所在地。从1952年到1960年，学校共培养中师学生2000余人，培训小学行政干部培训班学员400多人，先后在原孝感地区开办若干中师函授班，为地方培养了大批小学师资。